Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lig3P97386 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig3P97386 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms