Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frat1P70339 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frat1P70339 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frat1P70339 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms