Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.02
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Pkn1P70268 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkn1P70268 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pkn1P70268 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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