Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ufm1P61961 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ufm1P61961 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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