Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms