Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms