Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps5P59438 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps5P59438 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms