Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CgnP59242 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CgnP59242 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CgnP59242 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CgnP59242 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms