Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P58686 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P58686 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P58686 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P58686 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms