Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Setd4P58467 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms