Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms