Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms