Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms