Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt2P50752 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt2P50752 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt2P50752 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt2P50752 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt2P50752 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt2P50752 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms