Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms