Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cox8bP48772 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cox8bP48772 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms