Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax9P47242 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax9P47242 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms