Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtgfrP43117 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtgfrP43117 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PtgfrP43117 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PtgfrP43117 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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