Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TfamP40630 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TfamP40630 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TfamP40630 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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