Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VhlP40338 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VhlP40338 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VhlP40338 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VhlP40338 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VhlP40338 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VhlP40338 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms