Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ThpoP40226 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ThpoP40226 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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