Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cap1P40124 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cap1P40124 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms