Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf1P39428 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf1P39428 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf1P39428 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms