Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HmgclP38060 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HmgclP38060 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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