Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig1P37913 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms