Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprkP35822 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprkP35822 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprkP35822 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms