Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms