Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd1P33215 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms