Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxc11P31313 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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