Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxa10P31310 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa10P31310 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms