Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms