Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msr1P30204 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms