Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col2a1P28481 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms