Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Psmb9P28076 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms