Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lef1P27782 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lef1P27782 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms