Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2afxP27661 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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