Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U2af2P26369 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms