Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CftrP26361 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CftrP26361 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CftrP26361 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CftrP26361 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CftrP26361 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CftrP26361 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CftrP26361 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CftrP26361 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CftrP26361 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms