Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChgaP26339 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms