Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ggta1P23336 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms