Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TP20293 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TP20293 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TP20293 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TP20293 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TP20293 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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