Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NefhP19246 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NefhP19246 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NefhP19246 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NefhP19246 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NefhP19246 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms