Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnnc1P19123 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms