Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms