Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms