Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DmdP11531 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DmdP11531 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms