Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lamp1P11438 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms