Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Myod1P10085 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Myod1P10085 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms