Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CatspereP0DP43 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms