Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf1P09925 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf1P09925 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Surf1P09925 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf1P09925 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Surf1P09925 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms